復旦大學附屬中山醫(yī)院是國家衛(wèi)生和計劃生育委員會預算管理單位，是復旦大學的附屬綜合性教學醫(yī)院。醫(yī)院開業(yè)于1937年，是當時中國人管理的第一所大型綜合性醫(yī)院，隸屬于國立上海醫(yī)學院，為紀念中國民主革命的先驅(qū)孫中山先生而命名為孫中山紀念醫(yī)院，后更名為中山醫(yī)院。解放后曾稱上海第一醫(yī)學院附屬中山醫(yī)院和上海醫(yī)科大學附屬中山醫(yī)院，2001年用現(xiàn)名。1991年12月經(jīng)衛(wèi)生部批準，成為上海市第一批三級甲等醫(yī)院。
醫(yī)院設有除兒科以外的所有科室、綜合實力雄厚。心臟、肝癌、腎臟和肺部疾病診治是醫(yī)院的重點和特色，診治水平始終處于國內(nèi)領先地位。國家臨床重點專科18個：消化科、檢驗科、麻醉科、心血管內(nèi)科、內(nèi)分泌科、胸外科、心臟大血管外科、臨床護理、中醫(yī)腦病科、呼吸內(nèi)科、腎病科、普通外科、重癥醫(yī)學科、腫瘤科、醫(yī)學影像科、器官移植科、急診醫(yī)學科和神經(jīng)內(nèi)科。心血管病和肝腫瘤為上海市臨床醫(yī)學中心。上海市心血管病研究所、復旦大學肝癌研究所、上海市影像醫(yī)學研究所、上海市呼吸病研究所、上海市中西醫(yī)結(jié)合康復研究所、上海市肝病研究所、復旦大學呼吸病研究所、復旦大學血管外科研究所、復旦大學普通外科研究所、復旦大學內(nèi)鏡診療研究所、復旦大學核醫(yī)學研究所也設在院內(nèi)，成為醫(yī)院重要的研究機構(gòu)。上海市的院內(nèi)感染、超聲診斷、呼吸內(nèi)科、心血管內(nèi)科、胸心外科、普通外科6個臨床質(zhì)量控制中心也掛靠中山醫(yī)院。醫(yī)院每年承擔國家級、省部級重大科研項目近百項。近年獲國家級、教育部、國家衛(wèi)生計生委和上海市科技成果獎百項。設有博士點15個，碩士點21個，博士后流動工作站1個，有經(jīng)國家衛(wèi)生計生委或上海市衛(wèi)生計生委批準的住院醫(yī)師規(guī)范化培訓基地15個，？漆t(yī)師規(guī)范化培訓基地19個。每年舉辦國家級繼續(xù)醫(yī)學教育學習班逾50期，招收進修醫(yī)生超過700名，為國家培養(yǎng)了許多高級醫(yī)學人才。
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